Tamanho do genoma
O tamanho do genoma refere-se à quantidade total de ADN contido numa cópia de um genoma. É tipicamente medido em termos de massa ou como o número total de pares de bases de nucleótidos (tipicamente em milhões de pares de bases ou megabases [abreviado Mb ou Mbp]).
Uma picograma (pg) equivale a 978 megabases (Mb). Em organismos diplóides, o tamanho do genoma é usado de igual maneira que o termo valor C. Interessantemente, a complexidade de um organismo não é directamente proporcional ao tamanho do genoma; alguns organismos unicelulares possuem muito mais ADN que os humanos.
As diferenças de tamanhos dos genomas ocorrem pelo acúmulo de elementos transponíveis que representam várias classes que se multiplicam e se mobilizam nos genomas eucarióticos e procarióticos. Esses elementos não codificam normalmente funções do organismo hospedeiro e podem ser considerados como unidades evolutivas relativamente independentes, algumas vezes vistos como comensais, mas outras vezes são vistos como mutualistas ou parasitas moleculares. Logo, não há uma relação entre tamanho de genomas e “complexidade biológica” e sim uma relação com a quantidade de elementos transponíveis. Assim, grande quantidade desses elementos podem gerar o DNA “entulho” que correspondem a segmentos repetitivos.
Tabela de Referência
| Tipo de organismo | Organismo | Tamanho do genoma (Par de bases) | Nota |
|---|---|---|---|
| Vírus | Bacteriophage MS2 | 3.569 | Primeiro sequenciamento de um genoma-RNA.[1] |
| Vírus | SV40 | 5.224 | [2] |
| Vírus | Phage Φ-X174 | 5.386 | Primeiro sequenciamento de um genoma-DNA.[3] |
| Vírus | Phage λ | 48.502 | |
| Bactéria | Haemophilus influenzae | 1.830.000 | Primeiro genoma de um organismo vivo, em julho de 1995.[4] |
| Bactéria | Carsonella ruddii | 160.000 | O menor genoma de um organismo não-viral.[5] |
| Bactéria | Buchnera aphidicola | 600.000 | |
| Bactéria | Wigglesworthia glossinidia | 700.000 | |
| Bactéria | Escherichia coli | 4.600.000 | [6] |
| Ameba | Amoeba dubia | 670.000.000.000 | O maior genoma conhecido.[7] |
| Planta | Arabidopsis thaliana | 157.000.000 | Primeiro sequenciamento do genoma de uma planta, em dezembro de 2000.[8] |
| Planta | Genlisea margaretae | 63.400.000 | O menor genoma de planta com flores registrado, 2006.[8] |
| Planta | Fritillaria assyrica | 130.000.000.000 | |
| Planta | Populus trichocarpa | 480.000.000 | Primeiro sequenciamento do genoma de uma árvore, em setembro de 2006. |
| Musgos | Physcomitrella patens | 480.000.000 | Primeiro sequenciamento do genoma de uma briófita, em janeiro de 2008.[9] |
| Levedura | Saccharomyces cerevisiae | 12.100.000 | [10] |
| Fungo | Aspergillus nidulans | 30.000.000 | |
| Nematódeos | Caenorhabditis elegans | 98.000.000 | Primeiro sequenciamento do genoma de um animal multicelular, em dezembro de 1998.[11] |
| Inseto | Drosophila melanogaster (fruit fly) | 130.000.000 | [12] |
| Inseto | Bombyx mori | 530.000.000 | |
| Inseto | Apis mellifera | 1.770.000.000 | |
| Peixe | Tetraodon nigroviridis | 385.000.000 | O menor genoma conhecido de um vertebrado. |
| Mamífero | Homo sapiens | 3.200.000.000 | |
| Peixe | Protopterus aethiopicus | 130.000.000.000 | O maior genoma conhecido de um vertebrado. |
Nota: O DNA de uma única célula humana tem aproximadamente 1,8 metros de comprimento (porém com uma largura de aproximadamente 2,4 nanômetros).
Ver também
- Animal Genome Size Database
- Núcleo celular
- Genómica comparativa
- Valor C
- Enigma do valor C
- Genoma
- Genoma humano
- ADN não-codificante
- Elementos transponíveis
Referências
- ↑ Fiers W; et al. (1976). «Complete nucleotide-sequence of bacteriophage MS2-RNA - primary and secondary structure of replicase gene». Nature. 260: 500–507. PMID 1264203. doi:10.1038/260500a0
- ↑ Fiers W, Contreras R, Haegemann G, Rogiers R, Van de Voorde A, Van Heuverswyn H, Van Herreweghe J, Volckaert G, Ysebaert M (1978). «Complete nucleotide sequence of SV40 DNA». Nature. 273 (5658): 113–120. PMID 205802. doi:10.1038/273113a0
- ↑ Sanger F, Air GM, Barrell BG, Brown NL, Coulson AR, Fiddes CA, Hutchison CA, Slocombe PM, Smith M (1977). «Nucleotide sequence of bacteriophage phi X174 DNA». Nature. 265 (5596): 687–695. PMID 870828. doi:10.1038/265687a0
- ↑ Fleischmann R, Adams M, White O, Clayton R, Kirkness E, Kerlavage A, Bult C, Tomb J, Dougherty B, Merrick J (1995). «Whole-genome random sequencing and assembly of Haemophilus influenzae Rd». Science. 269 (5223): 496–512. PMID 7542800. doi:10.1126/science.7542800
- ↑ Nakabachi A, Yamashita A, Toh H; et al. (outubro de 2006). «The 160-kilobase genome of the bacterial endosymbiont Carsonella». Science (journal). 314 (5797). 267 páginas. PMID 17038615. doi:10.1126/science.1134196
- ↑ Frederick R. Blattner, Guy Plunkett III; et al. (1997). «The Complete Genome Sequence of Escherichia coli K-12». Science. 277: 1453–1462. PMID 9278503. doi:10.1126/science.277.5331.1453
- ↑ Parfrey, L.W.; Lahr, D.J.G.; Katz, L.A. (2008). «The Dynamic Nature of Eukaryotic Genomes». Molecular Biology and Evolution. 25 (4). 787 páginas. PMID 18258610. doi:10.1093/molbev/msn032
- ↑ a b Greilhuber, J., Borsch, T., Müller, K., Worberg, A., Porembski, S., and Barthlott, W. (2006). «Smallest angiosperm genomes found in Lentibulariaceae, with chromosomes of bacterial size». Plant Biology. 8: 770–777. PMID 17203433. doi:10.1055/s-2006-924101
- ↑ Daniel Lang, Andreas D. Zimmer, Stefan A. Rensing, Ralf Reski(2008): Exploring plant biodiversity: the Physcomitrella genome and beyond. Trends in Plant Science 13, 542-549. [1]
- ↑ [2]
- ↑ The C. elegans Sequencing Consortium (1998). «Genome sequence of the nematode C. elegans: a platform for investigating biology». Science. 282 (5396): 2012–2018. PMID 9851916. doi:10.1126/science.282.5396.2012
- ↑ Adams MD, Celniker SE, Holt RA; et al. (2000). «The genome sequence of Drosophila melanogaster». Science. 287 (5461): 2185–95. PMID 10731132. doi:10.1126/science.287.5461.2185. Consultado em 25 de maio de 2007